外泌体研究
外泌体全转录组测序服务
外泌体中携带有来自母本细胞的多种蛋白质、脂类、RNA等重要信息。对外泌体中的长链RNAs进行全转录组测序分析,一次测序实验,即可以获得上万条长链RNAs的检测数据,全面覆盖 mRNA、lncRNA和 circRNA等长链RNAs。外泌体全转录组测序数据量大、信息全面,是发现特异性疾病诊断标志物、进行多组学分析的重要手段。同时,由于外泌体携带的长链RNAs中有超过70%为mRNA,外泌体全转录组测序的结果不仅可以进行深入的基因功能注释,而且还能够分析到外泌体可能来源的细胞类型及占比(即外泌体溯源)。
| 华盈生物全转录组测序服务
华盈生物外泌体全转录组测序服务体系,充分结合了专利微量核酸建库技术、NGS技术和全新的生物信息序列比对算法,可对血浆中外泌体的mRNA、lncRNA和circRNA 等RNAs进行充分捕获和测序,可以实现从1mL血浆分离的外泌体中,稳定检出超过1万条长链RNAs。
| 分析内容
| 经典案例:血浆外泌体全转录组筛选胰腺癌标志物发现
2020年,复旦大学附属肿瘤医院研究团队从1mL血浆中分离外泌体,利用专利建库技术进行全转录组测序,成功筛选到了8种长链RNA,其形成的胰腺癌诊断标志物组合,比传统的CA19-9更加灵敏和特异。
外泌体全转录组测序结果显示:入组人群血浆外泌体中的mRNA普遍富集度最高,其次是LncRNA。随机森林等数据分析发现8种长链RNA在PDAC患者中普遍高于CP和HC组,可作为潜在诊断标志物。由8种长链RNA组成的标志物组合d-signature对于Ⅰ和Ⅱ期胰腺导管腺癌的诊断效能AUC 达到0.949, 远高于经典标志物CA19 -9 。联合d-signature和CA19-9诊断时,诊断效能进一步提高到AUC=0.964。
| 华盈优势
1. 一站式服务体系:
客户只需提供血浆样本,华盈生物为您完成从样品准备,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。
2.专利建库技术:
华盈生物采用的专利微量核酸建库技术,可对仅1mL血浆中提取的外泌体RNA进行建库和测序分析。
3.专业生物信息分析:
华盈生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求,相关分析示例如下:
| 相关文献
[1].Du X, Jiang Y, Zhang Q, et al. Genome-Wide Profiling of Exosomal Long Noncoding RNAs Following Air Pollution Exposure: A Randomized, Crossover Trial. Environ Sci Technol. 2023;57(7):2856-2863.(复旦大学公共卫生学院)IF=10.8
[2]. Du X, Zhang Q, Jiang Y, et al. Dynamic molecular choreography induced by traffic exposure: A randomized, crossover trial using multi-omics profiling.J Hazard Mater. 2022;424(Pt A):127359.(复旦大学)IF=12.2
[3]. Ji J, Chen R, Zhao L, et al. Circulating exosomal mRNA profiling identifies novel signatures for the detection of prostate cancer. Mol Cancer. 2021;20(1):58.(中国上海海军医科大学)IF=27.7
[4]. Yu S, Li Y, Liao Z, et al. Plasma extracellular vesicle long RNA profiling identifies a diagnostic signature for the detection of pancreatic ductal adenocarcinoma. Gut. 2020;69(3):540-550.(复旦大学附属肿瘤综合科)IF=23.0
[5]. Chen CW, Fu M, Du ZH, et al. Long Noncoding RNA MRPL23-AS1 Promotes Adenoid Cystic Carcinoma Lung Metastasis. Cancer Res. 2020;80(11):2273-2285.(北京大学口腔医学院)IF=11.4
[6].Li Y, Zhao J, Yu S, et al. Extracellular Vesicles Long RNA Sequencing Reveals Abundant mRNA, circRNA, and lncRNA in Human Blood as Potential Biomarkers for Cancer Diagnosis. Clin Chem. 2019;65(6):798-808.(复旦大学附属肿瘤医院)IF=7.1
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