外泌体研究

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外泌体全转录组测序服务

华盈生物推出的外泌体全转录组测序服务,不仅可以进行深入的基因功能注释,而且还能够分析到外泌体可能来源的细胞类型及占比(外泌体溯源),对于深入了解不同发育阶段或疾病状态背后的外泌体调控机制具有十分重要的意义。
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       外泌体中携带有来自母本细胞的多种蛋白质、脂类、RNA等重要信息。对外泌体中的长链RNAs进行全转录组测序分析,一次测序实验,即可以获得上万条长链RNAs的检测数据,全面覆盖 mRNA、lncRNA和 circRNA等长链RNAs。外泌体全转录组测序数据量大、信息全面,是发现特异性疾病诊断标志物、进行多组学分析的重要手段。同时,由于外泌体携带的长链RNAs中有超过70%为mRNA,外泌体全转录组测序的结果不仅可以进行深入的基因功能注释,而且还能够分析到外泌体可能来源的细胞类型及占比(即外泌体溯源)。

 
 
 

 

|   华盈生物全转录组测序服务

       华盈生物外泌体全转录组测序服务体系,充分结合了专利微量核酸建库技术、NGS技术和全新的生物信息序列比对算法,可对血浆中外泌体的mRNA、lncRNA和circRNA 等RNAs进行充分捕获和测序,可以实现从1mL血浆分离的外泌体中,稳定检出超过1万条长链RNAs。

|   分析内容

|   经典案例:血浆外泌体全转录组筛选胰腺癌标志物发现

       2020年,复旦大学附属肿瘤医院研究团队从1mL血浆中分离外泌体,利用专利建库技术进行全转录组测序,成功筛选到了8种长链RNA,其形成的胰腺癌诊断标志物组合,比传统的CA19-9更加灵敏和特异。

       外泌体全转录组测序结果显示:入组人群血浆外泌体中的mRNA普遍富集度最高,其次是LncRNA。随机森林等数据分析发现8种长链RNA在PDAC患者中普遍高于CP和HC组,可作为潜在诊断标志物。由8种长链RNA组成的标志物组合d-signature对于Ⅰ和Ⅱ期胰腺导管腺癌的诊断效能AUC 达到0.949, 远高于经典标志物CA19 -9 。联合d-signature和CA19-9诊断时,诊断效能进一步提高到AUC=0.964。

 

|   华盈优势

1. 一站式服务体系:

客户只需提供血浆样本,华盈生物为您完成从样品准备,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。

2.专利建库技术:

华盈生物采用的专利微量核酸建库技术,可对仅1mL血浆中提取的外泌体RNA进行建库和测序分析。

3.专业生物信息分析:

华盈生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求,相关分析示例如下:

 

 相关文献

[1]. Xihao Du, Qingli Zhang, Yixuan Jiang, et al. Dynamic molecular choreography induced by traffic exposure: A randomized, crossover trial using multi-omics profiling. J Hazard Mater. 2022 Feb 15;424(Pt A):127359. IF=10.588

[2]Jin Ji, Rui Chen, Lin Zhao, et al. Circulating exosomal mRNA profiling identifies novel signatures for the detection of prostate cancer. Mol Cancer. 2021 Mar 30;20(1):58. IF=27.401

[3]. Chu-Wen Chen, Min Fu, Zhi-Hao Du, et al. Long Noncoding RNA MRPL23-AS1 Promoteoid Cystic Carcinoma Lung Metastasis. Cancer Res. 2020 Jun 1;80(11):2273-2285. IF=12.479

[4]Shulin Yu, Yuchen Li, Zhuan Liao, et al. Plasma extracellular vesicle long RNA profiling identifies a diagnostic signature for the detection of pancreatic ductal adenocarcinoma]. Gut, 2019, 69(3):gutjnl-2019-318860. IF=23.059

[5]Yuchen Li, Jingjing Zhao, Shulin Yu, et al. Extracellular Vesicles Long RNA Sequencing Reveals Abundant mRNA, circRNA, and lncRNA in Human Blood as Potential Biomarkers for Cancer Diagnosis. Clin Chem. 2019 Jun;65(6):798-808. IF=8.327

关键词:
全转录组测序
华盈生物
外泌体研究
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发布时间:2021-08-11 17:21:10

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