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质谱项目中蛋白鉴定可以鉴定磷酸化、乙酰化等修饰嘛?结果中能看到哪一个氨基酸发生了修饰嘛?

质谱项目中蛋白鉴定可以鉴定磷酸化、乙酰化等修饰嘛?结果中能看到哪一个氨基酸发生了修饰嘛?

【概要描述】

质谱项目中蛋白鉴定可以鉴定磷酸化、乙酰化等修饰嘛?结果中能看到哪一个氨基酸发生了修饰嘛?

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  • 分类:蛋白质谱FAQ
  • 作者:华盈生物
  • 来源:
  • 发布时间:2024-01-23 13:56
  • 访问量:
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1)3种常规修饰:氧化,烷基化,乙酰化。

2)一般磷酸化、泛素化前期需要做富集,自然状态下的磷酸化、乙酰化的量非常少,串联质谱根据母离子的丰度选取 topN 进行二级碎裂来检测,若前期不进行富集,最终鉴定到的磷酸化、乙酰化肽段可能不多。若客户不做富集,只在搜库时加搜修饰,则最多接受6种修饰,且涉及收费,500元/例。磷酸化富集方法有TiO2富集、PTMscan等,

目前华盈可接磷酸化蛋白组的相对定量蛋白组质谱分析。

3)多肽信息表中(peptide)包含具体哪一个氨基酸位点发生了修饰。

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