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质谱项目中蛋白鉴定可以鉴定磷酸化、乙酰化等修饰嘛？结果中能看到哪一个氨基酸发生了修饰嘛？
【概要描述】
- 分类：蛋白质谱FAQ
- 作者：华盈生物
- 来源：
- 发布时间：2024-01-23 13:56
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1）3种常规修饰：氧化，烷基化，乙酰化。
2）一般磷酸化、泛素化前期需要做富集，自然状态下的磷酸化、乙酰化的量非常少，串联质谱根据母离子的丰度选取 topN 进行二级碎裂来检测，若前期不进行富集，最终鉴定到的磷酸化、乙酰化肽段可能不多。若客户不做富集，只在搜库时加搜修饰，则最多接受6种修饰，且涉及收费，500元/例。磷酸化富集方法有TiO2富集、PTMscan等，
目前华盈可接磷酸化蛋白组的相对定量蛋白组质谱分析。
3）多肽信息表中（peptide）包含具体哪一个氨基酸位点发生了修饰。
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