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①检测细胞数量。单细胞技术是对3000-30000个细胞进行测序检测，由于检测的细胞数量较少，不一定能够反应出复杂组织中的细胞占比，对于罕见细胞亚群的分辨率也不够。如果再考虑人为取样偏差和组织异质性问题，就会严重影响单细胞测序的数据可信度。CyTOF 技术每次实验对多达100万个细胞的蛋白质进行检测，不仅细胞分型数据更为准确，对于与占比较小的细胞亚群也能够精确分析。
②检测对象。单细胞测序检测的是RNA 水平的，CyTOF检测的是蛋白水平。RNA反映的是调控过程，不是决定细胞的功能效应因子，其变化不一定会同步体现在蛋白质上。而蛋白质是生物功能的最终体现者。因此定义细胞的种类和功能，蛋白质层面的证据更为直接和准确。
③单细胞测序一般需要蛋白层面的验证，例如免疫组化、流式、CyTOF 等，从RNA层面有差异不一定在蛋白层面能验证出来。另外，单细胞测序筛选到的差异基因不一定能买的对应的抗体。
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发布时间：2021-08-11 17:21:10
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发布时间：2023-06-09 17:38:30
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