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单细胞测序与CyTOF的区别?

单细胞测序与CyTOF的区别?

【概要描述】

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  • 分类:技术解答
  • 作者:华盈生物
  • 来源:
  • 发布时间:2024-03-29 12:53
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①检测细胞数量。单细胞技术是对3000-30000个细胞进行测序检测,由于检测的细胞数量较少,不一定能够反应出复杂组织中的细胞占比对于罕见细胞亚群的分辨率也不够。如果再考虑人为取样偏差和组织异质性问题,就会严重影响单细胞测序的数据可信度。CyTOF 技术每次实验对多达100万个细胞的蛋白质进行检测,不仅细胞分型数据更为准确,对于与占比较小的细胞亚群也能够精确分析。

②检测对象。单细胞测序检测的是RNA 水平的,CyTOF检测的是蛋白水平。RNA反映的是调控过程,不是决定细胞的功能效应因子,其变化不一定会同步体现在蛋白质上。而蛋白质是生物功能的最终体现者因此定义细胞的种类和功能,蛋白质层面的证据更为直接和准确。

③单细胞测序一般需要蛋白层面的验证,例如免疫组化、流式、CyTOF 等,从RNA层面有差异不一定在蛋白层面能验证出来。另外,单细胞测序筛选到的差异基因不一定能买的对应的抗体。

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