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真实数据!一张切片实现101种蛋白的超多重空间单细胞原位成像

真实数据!一张切片实现101种蛋白的超多重空间单细胞原位成像

  • 分类:华盈视角
  • 作者:老纪
  • 来源:华盈生物公众号

【概要描述】引领空间新时代!PCF空间单细胞蛋白组学

真实数据!一张切片实现101种蛋白的超多重空间单细胞原位成像

【概要描述】引领空间新时代!PCF空间单细胞蛋白组学

  • 分类:华盈视角
  • 作者:老纪
  • 来源:华盈生物公众号
  • 发布时间:2024-03-21 14:23
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头颈鳞状细胞癌 (HNSCC) 是第七大常见癌症。免疫检查点抑制剂 (ICIs) 在治疗复发/转移病例方面显示出良好前景,约30%的患者可获得持久获益。但是目前反映HNSCC肿瘤微环境 (TME) 特征的生物标志物有限,需要更深入的组织表征分析。因此,需要新的生物标志物来准确对患者进行分层并预测对治疗的反应。来自美国Akoya Biosciences的科学家同时使用一组101种抗体对HNSCC组织开展了PhenoCycler-FusionPCF)空间单细胞蛋白组分析。这些抗体靶标包括了肿瘤免疫、代谢和应激微环境相关的生物标志物。

PCF空间单细胞蛋白组数据揭示了头颈肿瘤固有的高度异质性,为肿瘤生物学提供了独特的见解。特别是细胞邻域分析揭示了患者组织中存在 6个独特的空间肿瘤免疫邻域,这些邻域富含功能独特的免疫细胞子集。此外,基于关键代谢和应激的功能表型确定了四个具有差异蛋白质特征的不同肿瘤区域。其中一个肿瘤区域以CD8+ T细胞浸润和BAK(一种促凋亡调节因子)过度表达为标志,表明该区域强烈的免疫激活和应激。同一肿瘤内的另一个邻近区域高表达肿瘤抵抗和侵袭的已知驱动蛋白G6PD和MMP9。同一样本出现了免疫激活诱导的死亡和促肿瘤生长的两种空间微环境,证明了对治疗耐药性临床反应的异质生态位和竞争性微环境特征。总之,该研究将空间原位超高复杂单细胞信息与肿瘤微环境的功能状态相结合,为HNSCC中免疫检查点抑制剂治疗的部分响应提供了新的见解。

|   主要结果展示

全片成像

空间单细胞表型分析

肿瘤细胞异质性分析

细胞邻域分析

空间单细胞代谢分析

肿瘤代谢异质性分析

| PCF空间单细胞蛋白组学介绍

PCF采用oligo偶联抗体检测技术结合自动化高分辨荧光显微镜,可实现超多靶标的空间定位及单细胞分辨率下的细胞表型分析。所有抗体先一次性与组织切片结合,再启动抗体和荧光探针的“杂交 — 成像 — 剥离”三步循环,每次循环后通过荧光显微镜收集检测抗体的荧光信号。

| PCF空间单细胞蛋白组学优势

华盈生物PhenoCycler-Fusion单细胞原位空间蛋白组学技术资格证书

华盈生物是美国Akoya Bioscience公司的PhenoCycler-Fusion空间单细胞蛋白组学技术认证服务商,已经被纳入了该技术的全球CRO服务提供者体系。借助全球领先的PhenoCycler-Fusion空间单细胞蛋白组学技术平台的建立,华盈生物将为中国客户提供更具精准医学特色的服务与合作,推动中国团队在空间生物学领域的研究水平,加快构建符合中国人群的精准医学模式。

即刻加入“STAMP邮戳”计划

华盈生物推出肿瘤微环境空间蛋白组解剖分析项目”STAMP邮戳”计划(Spatial Tumor Anatomy of Microenvironment Proteome),常备15-plex、25-plex、35-plex三款组合性panel,与国内肿瘤研究领域的科学家共同推进肿瘤空间生物学研究。

 

|   相关文献

Jhaveri N et al. Mapping the Spatial Proteome of Head and Neck Tumors: Key Immune Mediators and Metabolic Determinants in the Tumor Microenvironment. GEN Biotechnology.2023; 2(5):418-434.

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