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想知道某个基因在信号通路中的作用,可以使用信号通路抗体芯片吗?

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我们有很多类似研究方向的文献应用到信号通路抗体芯片(Kang Sumin, et al.J. Clin.Invest. 2010 Jia D et al. Cell research, 2014)。比如 JCI 文献中,研究人员发现这个基因与头颈部肿瘤的高转移密切相关,由于 RSK2 属于 MAPK 信号通路,在探索机理的时候,研究人员将 RSK2 在细胞系中进行敲除后用蛋白芯片去研究 MAPK 通路的变化,结果迅速定位到 MAPK 通路中受到 RSK2 敲除扰动的蛋白及磷酸化位点,为机理的解释奠定了基础。在 Cell Research 这篇文章中, 研究人员遇到同样的问题,他们发现 MPZL1 这个蛋白与肝癌的转移密切相关,而 MPZL1 并不属于现有经典信号通路,因此作者将采用 PEX100 芯片将现有的大多数信号通路分子进行全面筛选,结果自己找到了一条受到 MPZL1 敲除扰动最大的新的信号通路,完整的解释了 MPZL1 基因与肝癌转移的关系。

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