CyTOF技术显示出了在细胞抗原检测进行亚型分析方面的超级强大优势。本研究使用了CyTOF对122例Omicron感染患者和50例未感染者的外周血单个核细胞（PBMC）进行了检测，共使用了41个免疫细胞表面marker，鉴定出了45个细胞亚群。在T细胞亚群中，结果显示接种三剂灭活疫苗可以通过激活naïve CD4⁺ T细胞产生效应记忆CD4⁺ T细胞（图1A）。

在NK细胞亚群中，CD56^hiCD16^lo细胞因子分泌型NK细胞亚群在接种三剂灭活疫苗后频率降低，而CD56^intCD16^hi细胞毒性NK亚群在接种三剂灭活疫苗后频率增加（图1B）。

在单核细胞方面，结果显示三剂灭活疫苗可以促进单核/树突状细胞的活化和分化（图1C）。

作者通过RNA-seq技术对健康受试者及Omicron感染患者的外周血进行了检测，结果同样表明，三剂灭活疫苗的接种可能是通过促进单核/树突状细胞的活化，同时抑制致病性Treg细胞的增殖，最终实现对Omicron感染的有效抵抗。

图2 健康受试者和Omicron感染者外周血的免疫细胞相关基因表达热图

血浆细胞因子的变化是机体免疫反应的综合表现之一，高通量的分泌蛋白检测技术也在本研究中得到应用，并且发现了在细胞因子水平和感染及疫苗相关的重要标志型的分泌蛋白（图3A）。

图3 健康受试者与Omicron感染者接种疫苗后外周血浆差异蛋白

多组学的联合应用已经被广大的科研人员普遍接受，本研究中综合应用了单个细胞水平的质谱流式细胞技术、高通量的分泌蛋白检测技术、以及转录组技术，最终发现了三剂疫苗的特征，即在患者体内引起单核细胞的激活和分化，从而在Omicron感染时产生保护性免疫。

1）“蛋白芯片”和“蛋白质谱”双平台技术服务体系将完美助力于血液蛋白、细胞因子、外泌体蛋白标志物的发现，双管齐下，最大限度的不漏筛低丰度的血液蛋白，发现最具临床意义的标志物。

2）包含大约2万多种人类蛋白的“人类蛋白组芯片”，可用来全面筛选血液自身抗体，发现肿瘤、自身免疫疾病等新的自身抗体诊断标志物。

3）“ISOP单细胞功能蛋白组”可实现对单个细胞亚群分泌蛋白组的检测，发现关键的多功能性细胞，作为肿瘤免疫治疗、CAR-T细胞治疗的预测标志物。

4）质谱流式细胞术（CyTOF）可以支持全血样本、组织样本、单细胞悬液等多种样本类型的分析，抗体库包含常用的人源抗体500多种，鼠源抗体300多种，可以实现对细胞亚型、细胞功能的精准分析。

5）空间单细胞蛋白组学（IMC+PCF）可获得特定组织结构中细胞亚群数量、细胞邻域的关系图谱、细胞通讯网络、以及免疫检查点等关键功能蛋白在单个细胞上的表达定位等深度空间信息，可用于疾病机制靶点和诊断、疗效、预后等标志物的发现。

|   相关文献

Yu S, Lin Y, Li Y et al. Systemic immune profiling of Omicron-infected subjects inoculated with different doses of inactivated virus vaccine. Cell. 2023 ; S0092-8674(23)00964-9.