这是描述信息

新闻资讯

新闻资讯
留言咨询
与最新消息保存同步
/
/
ACS Nano(IF=17.1):北京协和医学院揭示血清细胞外囊泡miRNA作为卵巢癌诊断和预后标志物

ACS Nano(IF=17.1):北京协和医学院揭示血清细胞外囊泡miRNA作为卵巢癌诊断和预后标志物

  • 分类:华盈视角
  • 作者:标志物研究俱乐部
  • 来源:

【概要描述】循环细胞外囊泡及其分子货物可用于癌症诊断和预后的生物标志物。

ACS Nano(IF=17.1):北京协和医学院揭示血清细胞外囊泡miRNA作为卵巢癌诊断和预后标志物

【概要描述】循环细胞外囊泡及其分子货物可用于癌症诊断和预后的生物标志物。

  • 分类:华盈视角
  • 作者:标志物研究俱乐部
  • 来源:
  • 发布时间:2023-10-11 13:53
  • 访问量:
详情

肿瘤生物标志物CA125和HE4对于上皮性卵巢癌(EOC)检测的特异性和敏感性相对较低,这两种标志物都无法区分良性肿瘤和EOC并提供准确的预后。最近的一些研究表明,循环细胞外囊泡及其分子货物可用于癌症诊断和预后的生物标志物。然而,目前还没有可靠且有效的细胞外囊泡生物标志物用于临床上EOC的早期检测和预后预测。

2023年9月26日,中国医学科学院北京协和医学院梁智勇教授团队在ACS Nano(IF=17.1)发表题为“Identifying Serum Small Extracellular Vesicle MicroRNA as a Noninvasive Diagnostic and Prognostic Biomarker for Ovarian Cancer”的文章,发现血清来源的细胞外囊泡miRNA可区分良性和恶性肿瘤并可用于预测EOC患者预后。

|   研究设计

研究分为训练集(n=29)、测试集(n=20)和验证集(n=30)。对训练集开展外泌体miRNA测序,将测序结果与组织样本数据集(n = 197)整合,确定了7 个sEV miRNA,在训练集中成功建立了用于识别 EOC 的血清 sEV miRNA 模型(sEVmiR-EOC),该模型在测试队列和验证队列中得到qPCR证实,可用于诊断和预后。

|   研究结果

1、训练集确定外泌体差异miRNA

从良性和恶性EOC患者的血清样本中分离sEV,开展miRNA测序,根据阈值(截止值 log2CPM > 2,|FC| > 1.5,p < 0.05)确定了16个差异表达的miRNA,与组织miRNA数据库(GSE53829)整合分析后,7个miRNA(miR-1246、miR-141-3p、miR-200a-3p、miR-200b-3p、miR-200c-3p、miR- 203a-3p 和 miR-429)被选择(图1A),这些miRNA在训练集的EOC患者中显著上调(图1B),这7个miRNA的上调同样在数据集GSE65819、GSE127873和TCGA中得到证实。

图1 发现集确定外泌体差异miRNA

2、sEVmiR-EOC模型的构建和诊断效能

研究进一步构建了一个血清sEV miRNA诊断模型(sEVmiR-EOC score = Σ(回归系数)× (miRNA表达量)− 3.6501),在训练集中sEVmiR-EOC模型识别EOC的AUC为0.913(特异性:0.923;灵敏度:0.875),在测试队列中的AUC为0.973(特异性:1.000;灵敏度:0.867),在验证集中的AUC为0.924(特异性:0.933;灵敏度:0.867)(图2A)。此外,sEVmiR-EOC模型的RiskScore评估显示恶性组的风险远高于良性组(图2B),sEVmiR-EOC模型在CA125高的样本中的RiskScore显著高于CA125正常个体(图2C),且基于RiskScore的sEVmiR-EOC诊断模型相较于CA125表现出更好的性能(图2D)。

图2 sEVmiR-EOC模型的构建和验证

3、sEVmiR-EOC模型的预后预

进一步分析发现这7种miRNA的血清sEV miRNA在术前良性组、术前恶性组、术后R0组(术后无肉眼残留病灶为R0)和术后残留组的EOC患者中存在显著差异(图3A)。恶性患者术前sEVmiR-EOC RiskScore显著大于术后R0,术前恶性组和术后残留组的EOC患者没有差异(图3B)。与术前恶性组相比,miR-141-3p、miR-200a-3p、miR-200b-3p、miR-200c-3p 和 miR-429在术后R0组中显著下调(图3C)。此外,术后RiskScore较高的个体与较差的PFS显著相关(图3D)。

图3 sEVmiR-EOC模型的预后预测

综上所述,sEVmiR-EOC模型可能在EOC的诊断和预后预测方面具有广阔的应用前景(图4)。

图4 研究流程及结果图

|   总结与讨论

开发出用于诊断和预后的特异性、敏感性和非侵入性生物标志物有利于患者的临床管理。该研究首先通过miRNA测序结果,选择了16个差异表达的miRNA,随后利用组织miRNA的公共数据集进一步缩小范围,确定 7个差异表达的miRNA,并建立sEVmiR-EOC模型通过训练集、测试集和验证集确认可用于EOC的诊断和预后。该研究对我们开展其他疾病的血清外泌体miRNA标志物提供了很好地研究范本。

华盈生物--血液标志物完整解决方案构建者

1)“蛋白芯片”和“蛋白质谱”双平台技术服务体系将完美助力于血液蛋白标志物的发现,双管齐下,最大限度的不漏筛低丰度的血液蛋白,发现最具临床意义的标志物。

2)“外泌体研究体系”可全面筛选血液外泌体中的RNA、蛋白、脂类等,针对外泌体微量体系,后续验证阶段华盈生物可提供数字PCR、Simoa等超灵敏检测技术,最大限度减少在大队列验证过程中数据缺失值的问题。目前华盈已经实现了外泌体“分离—鉴定—标志物筛选 —验证—建模”一站式服务体系。

3)“20k人类蛋白组芯片”包含大约2万多种人类蛋白,可全面筛选血液自身抗体,发现肿瘤、自身免疫疾病等新的自身抗体诊断标志物。

4)“ISOP单细胞功能蛋白组”可实现对单个细胞亚群的32种功能分泌蛋白组的检测,发现关键的多功能性细胞,作为肿瘤免疫治疗、CAR-T细胞治疗的预测标志物。

|   相关文献

Li L, Zhang F, Zhang J, et al. Identifying Serum Small Extracellular Vesicle MicroRNA as a Noninvasive Diagnostic and Prognostic Biomarker for Ovarian Cancer. ACS Nano. 2023 Sep 26. doi: 10.1021/acsnano.3c05694. Epub ahead of print. PMID: 37750402.

相关产品

华盈生物

地址:上海市闵行区绿洲环路396弄5幢4层

电话:400-869-2936,021-33968791

邮箱:support@wayenbiotech.com

传真:021-33938792

QQ:2120485725

战略合作

战略合作

发布时间:2021-08-11 17:21:10

|    Full Moon    |    RayBiotech    |    CDI    |    IZON    |    Bio-Rad    |    R&D Systems    |  IsoPlexis    |     Akoya    |     南模生物    |    欧易生物    |     上海实验动物研究中心    |     美吉生物    |    麦特绘谱    | 

 

特别说明:本网所有网页均为华盈生物原创信息,转载必须征求华盈生物同意,并同时注明本网名称及网址。

专利代码

发布时间:2023-06-09 17:38:30
Copyright © 2021 上海华盈生物医药科技有限公司 版权所有
搜索
搜索
关闭
客户留言
验证码