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ACS Nano(IF=17.1):北京协和医学院揭示血清细胞外囊泡miRNA作为卵巢癌诊断和预后标志物
- 分类:华盈视角
- 作者:标志物研究俱乐部
- 来源:
【概要描述】循环细胞外囊泡及其分子货物可用于癌症诊断和预后的生物标志物。
ACS Nano(IF=17.1):北京协和医学院揭示血清细胞外囊泡miRNA作为卵巢癌诊断和预后标志物
【概要描述】循环细胞外囊泡及其分子货物可用于癌症诊断和预后的生物标志物。
- 分类:华盈视角
- 作者:标志物研究俱乐部
- 来源:
- 发布时间:2023-10-11 13:53
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肿瘤生物标志物CA125和HE4对于上皮性卵巢癌(EOC)检测的特异性和敏感性相对较低,这两种标志物都无法区分良性肿瘤和EOC并提供准确的预后。最近的一些研究表明,循环细胞外囊泡及其分子货物可用于癌症诊断和预后的生物标志物。然而,目前还没有可靠且有效的细胞外囊泡生物标志物用于临床上EOC的早期检测和预后预测。
2023年9月26日,中国医学科学院北京协和医学院梁智勇教授团队在ACS Nano(IF=17.1)发表题为“Identifying Serum Small Extracellular Vesicle MicroRNA as a Noninvasive Diagnostic and Prognostic Biomarker for Ovarian Cancer”的文章,发现血清来源的细胞外囊泡miRNA可区分良性和恶性肿瘤并可用于预测EOC患者预后。
| 研究设计
研究分为训练集(n=29)、测试集(n=20)和验证集(n=30)。对训练集开展外泌体miRNA测序,将测序结果与组织样本数据集(n = 197)整合,确定了7 个sEV miRNA,在训练集中成功建立了用于识别 EOC 的血清 sEV miRNA 模型(sEVmiR-EOC),该模型在测试队列和验证队列中得到qPCR证实,可用于诊断和预后。
| 研究结果
1、训练集确定外泌体差异miRNA
从良性和恶性EOC患者的血清样本中分离sEV,开展miRNA测序,根据阈值(截止值 log2CPM > 2,|FC| > 1.5,p < 0.05)确定了16个差异表达的miRNA,与组织miRNA数据库(GSE53829)整合分析后,7个miRNA(miR-1246、miR-141-3p、miR-200a-3p、miR-200b-3p、miR-200c-3p、miR- 203a-3p 和 miR-429)被选择(图1A),这些miRNA在训练集的EOC患者中显著上调(图1B),这7个miRNA的上调同样在数据集GSE65819、GSE127873和TCGA中得到证实。
图1 发现集确定外泌体差异miRNA
2、sEVmiR-EOC模型的构建和诊断效能
研究进一步构建了一个血清sEV miRNA诊断模型(sEVmiR-EOC score = Σ(回归系数)× (miRNA表达量)− 3.6501),在训练集中sEVmiR-EOC模型识别EOC的AUC为0.913(特异性:0.923;灵敏度:0.875),在测试队列中的AUC为0.973(特异性:1.000;灵敏度:0.867),在验证集中的AUC为0.924(特异性:0.933;灵敏度:0.867)(图2A)。此外,sEVmiR-EOC模型的RiskScore评估显示恶性组的风险远高于良性组(图2B),sEVmiR-EOC模型在CA125高的样本中的RiskScore显著高于CA125正常个体(图2C),且基于RiskScore的sEVmiR-EOC诊断模型相较于CA125表现出更好的性能(图2D)。
图2 sEVmiR-EOC模型的构建和验证
3、sEVmiR-EOC模型的预后预测
进一步分析发现这7种miRNA的血清sEV miRNA在术前良性组、术前恶性组、术后R0组(术后无肉眼残留病灶为R0)和术后残留组的EOC患者中存在显著差异(图3A)。恶性患者术前sEVmiR-EOC RiskScore显著大于术后R0,术前恶性组和术后残留组的EOC患者没有差异(图3B)。与术前恶性组相比,miR-141-3p、miR-200a-3p、miR-200b-3p、miR-200c-3p 和 miR-429在术后R0组中显著下调(图3C)。此外,术后RiskScore较高的个体与较差的PFS显著相关(图3D)。
图3 sEVmiR-EOC模型的预后预测
综上所述,sEVmiR-EOC模型可能在EOC的诊断和预后预测方面具有广阔的应用前景(图4)。
图4 研究流程及结果图
| 总结与讨论
开发出用于诊断和预后的特异性、敏感性和非侵入性生物标志物有利于患者的临床管理。该研究首先通过miRNA测序结果,选择了16个差异表达的miRNA,随后利用组织miRNA的公共数据集进一步缩小范围,确定 7个差异表达的miRNA,并建立sEVmiR-EOC模型通过训练集、测试集和验证集确认可用于EOC的诊断和预后。该研究对我们开展其他疾病的血清外泌体miRNA标志物提供了很好地研究范本。
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| 相关文献
Li L, Zhang F, Zhang J, et al. Identifying Serum Small Extracellular Vesicle MicroRNA as a Noninvasive Diagnostic and Prognostic Biomarker for Ovarian Cancer. ACS Nano. 2023 Sep 26. doi: 10.1021/acsnano.3c05694. Epub ahead of print. PMID: 37750402.
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