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Biomark Res(IF=11.1):血清外泌体miRNA作为小细胞肺癌诊断和预后生物标志物
【概要描述】外泌体在生物标志物方面具有巨大的优势
- 分类:华盈视角
- 作者:小高
- 来源:标志物研究俱乐部
- 发布时间:2023-09-20 14:18
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外泌体在生物标志物方面具有巨大的优势,但外泌体miRNA是否可以作为小细胞肺癌诊断和预后生物标志物鲜有报道。
2023年9月13日,韩国蔚山大学研究人员在Biomarker Research(IF=11.1)发表了一篇题为“Identification of exosomal microRNA panel as diagnostic and prognostic biomarker for small cell lung cancer”的文章,鉴定了3个血清外泌体miRNA组成的Panel(miR-200b-3p、miR-3124-5p和miR-92b-5p)可以作为SCLC的诊断和预后标志物。
| 研究设计
研究分为发现集和验证集,采用超离的方法从SCLC患者和健康个体的血清中分离外泌体。发现集纳入5例SCLC患者和5例非癌性肺结节(对照),筛选差异miRNA;验证集纳入76例SCLC患者((28例局限性小细胞肺癌LD-SCLC, 48例广泛性小细胞肺癌ED-SCLC))和50例健康个体,开展qRT-PCR验证。
图1 研究设计
| 研究结果
1、发现集确定外泌体差异miRNA
通过检测5例SCLC患者和5例非癌性肺结节(对照)的血清外泌体,鉴定了对照中的1255个miRNA,SCLC中的1236个miRNA以及共同表达的856个miRNA(图2A)。根据FC > |2.0|和p值 < 0.05,确定31个外泌体miRNA差异表达(图2B、C)。此外不考虑P值,仅根据表达水平选择TOP20 miRNA(上调和下调各10个)(图2D),共确定了51个候选外泌体miRNA。
图2 发现集确定外泌体候选miRNA
2、验证集确定外泌体miRNA
使用发现集相同的样本(5例SCLC患者和5例非癌性肺结节)通过qRT-PCR验证51个候选外泌体miRNA,成功验证了25种。将25个miRNA在验证集(76例SCLC患者,50例健康个体)中进一步开展qRT-PCR验证,7个miRNA通过了验证,6个miRNA在SCLC外泌体中上调,1个miRNA在SCLC外泌体中下调(图3A-G)。其中,4种miRNA在局限性小细胞肺癌(LD)和广泛性小细胞肺癌(ED)患者中表现出显著差异。
图3 验证集中验证外泌体miRNA
3、外泌体miRNA组合用于SCLC诊断和预后
使用上述7种外泌体miRNA进行ROC分析来评估对SCLC的诊断效能,使用逻辑回归来确定最佳miRNA组合。3-miRNA Panel(miR-200b-3p、miR-3124-5p和miR-92b-5p)获得最高的ROC曲线下面积 (AUC = 0.93) (图4A)。此外,3-miRNA Panel诊断LD的AUC = 0.85,诊断ED的AUC = 0.92(图4B),表明3-miRNA Panel是SCLC诊断的最佳模型。根据上述3种miRNA的中位风险评分将SCLC患者被分为低风险[49例;LD:21(42.86%),ED:28(57.14%)]和高危人群[27例;LD:7(25.93%),ED:20(74.07%)](图4C),生存分析显示,高风险组患者的不良临床结果和死亡风险显著增加(图4D)。
图4 外泌体miRNA组合用于SCLC诊断和预后
| 总结与讨论
开发出用于诊断和预后的特异性、敏感性和非侵入性生物标志物有利于患者的临床管理。该研究首先筛选了51个差异表达的miRNA,随后利用该筛选队列样本使用qRT-PCR验证了25个miRNA,进一步在验证队列中验证了7个差异表达的miRNA,每个miRNA的AUC值在0.64和0.76之间,3-miRNA(miR-200b-3p、miR-3124-5p和miR-92b-5p)的联合应用显著提高了诊断价值(AUC = 0.93)。此外,3-miRNA Panel与较差的预后显著相关。研究对我们开展其他疾病的血清外泌体miRNA标志物提供了很好地研究范本。
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| 相关文献
Kim DH, Park H, Choi YJ, et al. Identification of exosomal microRNA panel as diagnostic and prognostic biomarker for small cell lung cancer. Biomark Res. 2023;11(1):80.
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