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质谱流式细胞技术怎样进行分析,能获得什么信息?
【概要描述】简单介绍质谱流式细胞技术怎样进行分析以及能获得什么信息
- 分类:技术解答
- 作者:华盈生物
- 来源:
- 发布时间:2023-09-19 13:50
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质谱流式细胞技术下机的FCS数据经过一系列的预处理(debarcode,gating)后进行生信分析,包含了聚类分析(heatmap),降维可视化(tSNE,UMAP),组间差异对比(boxplot),相关性分析(correlation),拟时序分析(pseudotime)等。通过初步的聚类分析我们可以得知聚类出来的细胞亚群marker表达特征以及占比,并根据marker表达对其进行细胞类型的注释,再通过后续分析发掘组间差异显著的关键性细胞亚群以及marker。
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