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有许多工具和数据库可用于蛋白组学富集分析,包括但不限于:
DAVID(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery): 用于功能和通路富集分析的在线工具。
GO(Gene Ontology)数据库: 提供基因和蛋白质功能注释的信息,常用于富集分析。
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes): 提供生物学通路信息,用于通路富集分析。
Reactome: 提供分子生物学通路和功能富集信息。
PANTHER(Protein Analysis Through Evolutionary Relationships): PANTHER数据库提供了蛋白质家族、功能和通路的富集分析工具。
MSigDB(Molecular Signatures Database): MSigDB包含了许多基因集,可以用于分析蛋白质组数据中的富集情况。
STRING(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins): STRING数据库关注蛋白质互作关系,可用于预测蛋白质相互作用的网络分析和富集分析。
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发布时间:2021-08-11 17:21:10
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发布时间:2023-06-09 17:38:30
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