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有许多工具和数据库可用于蛋白组学富集分析，包括但不限于：
DAVID（Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery）： 用于功能和通路富集分析的在线工具。
GO（Gene Ontology）数据库： 提供基因和蛋白质功能注释的信息，常用于富集分析。
KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）： 提供生物学通路信息，用于通路富集分析。
Reactome： 提供分子生物学通路和功能富集信息。
PANTHER（Protein Analysis Through Evolutionary Relationships）： PANTHER数据库提供了蛋白质家族、功能和通路的富集分析工具。
MSigDB（Molecular Signatures Database）： MSigDB包含了许多基因集，可以用于分析蛋白质组数据中的富集情况。
STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）： STRING数据库关注蛋白质互作关系，可用于预测蛋白质相互作用的网络分析和富集分析。
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