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Nature：PCF空间单细胞蛋白组构建人类肠道组织参考图谱

分类：近期动态
作者：华盈生物
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【概要描述】这项研究利用PCF空间单细胞蛋白组技术构建了人类肠道的详细图谱，提供了健康状态下小肠和结肠的第一个空间多重成像参考图谱。

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Nature：PCF空间单细胞蛋白组构建人类肠道组织参考图谱

【概要描述】这项研究利用PCF空间单细胞蛋白组技术构建了人类肠道的详细图谱，提供了健康状态下小肠和结肠的第一个空间多重成像参考图谱。

分类：近期动态
作者：华盈生物
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发布时间：2023-08-15 09:24
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成人肠道系统是一个复杂的器官，由约7m的小肠和2m的大肠组成。小肠在表型上是异质的，包括三个形态上不同的区域：十二指肠、空肠和回肠。大肠可分为升肠区、横肠区、降肠区和乙状结肠区。这些解剖区域都包含表型和形态上不同的细胞类型。之前的研究已经使用单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 绘制了细胞类型图，并对整个肠道的细胞类型进行了编排，但是缺少这些细胞的空间定位和互作信息。近期来自斯坦福医学院的研究人员在Nature发表了一项延伸性的研究，利用PCF空间单细胞蛋白组技术诠释了肠道组织结构图谱的文章。该研究定义了肠道内不同细胞类型的相对丰度和空间位置关系，包括不同肠道区域上皮细胞的复杂性，以及细胞组织成不同的多细胞结构生态位。并且联合单细胞测序绘制了这些细胞中的基因调控差异图谱，揭示了这些细胞类型间的调控分化级联关系。这项研究对肠道这个复杂器官的细胞功能、调节和组织结构提供了重要的见解，并为理解人类生物学和疾病提供了重要参考。

一、PCF空间单细胞蛋白组研究概括

研究分析了来自8个健康捐献者的组织样本，每个捐献者样本包括4个小肠组织区域和4个结肠组织区域的冰冻切片，总共64个组织切片。PCF空间单细胞蛋白组检测了54个蛋白指标，总共注释了25种细胞类型，覆盖了不同的基质细胞、表皮细胞和免疫细胞类型。不同细胞亚型在不同肠道区域的占比和密度不尽相同，说明了肠道不同区域的功能异质性。