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小分子药物靶点筛选方法比较:Pull down和人类蛋白质组芯片

小分子药物靶点筛选方法比较:Pull down和人类蛋白质组芯片

【概要描述】Pull down-LC/MS以及人类蛋白质组芯片技术都是现阶段对于小分子药物靶点筛选的主流方式。本文比较了这两种方式的异同。

小分子药物靶点筛选方法比较:Pull down和人类蛋白质组芯片

【概要描述】Pull down-LC/MS以及人类蛋白质组芯片技术都是现阶段对于小分子药物靶点筛选的主流方式。本文比较了这两种方式的异同。

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Pull down-LC/MS以及人类蛋白质组芯片技术都是现阶段对于小分子药物靶点筛选的主流方式。那么,这两种方法有什么异同点呢?

相同点

  1. 两种技术都需要对药物进行生物素修饰

     2.可以同时鉴定到几个到几百个靶点蛋白,筛选数目较多

不同点

  1. Pull down-LC/MS需要提供靶细胞样本检测,人类蛋白质组芯片可以直接采用小分子药物进行孵育检测,无需进行建模。。

     2.人类蛋白质组芯片实验为体外实验,芯片上每个蛋白点相互独立,保证筛选到的互作蛋白均为目标蛋白的直接结合蛋白,数据分析简单。Pull down-LC/MS 检测到的是与小分子有结合的蛋白复合物,不一定是直接结合的蛋白。

     3.Pull down-LC/MS很难发现低丰度蛋白,人类蛋白组芯片上的蛋白是酵母纯化表达的蛋白,可以保证每种蛋白的丰度,芯片实验容易发现潜在的结合蛋白

     4.利用人类蛋白组芯片实验筛选互作蛋白,从蛋白质层面分析互作数据,避免Pull down后质谱鉴定时,从多肽水平跨层分析互作蛋白的不确定性和复杂性。

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发布时间:2021-08-11 17:21:10

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