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20K人类蛋白质组芯片做小分子靶点筛选比pulldown+MS的优势有哪些？
- 分类：小分子药物靶点FAQ
- 作者：华盈生物
- 来源：
【概要描述】简单介绍了在做小分子靶点筛选是20k人类蛋白质组芯片比pulldown+MS的优势。
20K人类蛋白质组芯片做小分子靶点筛选比pulldown+MS的优势有哪些？
【概要描述】简单介绍了在做小分子靶点筛选是20k人类蛋白质组芯片比pulldown+MS的优势。
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- 作者：华盈生物
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- 发布时间：2023-07-26 14:23
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1）芯片实验为体外实验，芯片上每个蛋白点相互独立，保证筛选到的互作蛋白均为目标蛋白的直接结合蛋白，数据分析简单；pull down-LC/MS检测到的是与小分子有结合的蛋白复合物，不一定是直接结合的蛋白。
2）pulldown使用细胞内的蛋白进行检测，如果细胞中目的蛋白表达量少的话，拉下来的互作蛋白也少，质谱打出来目的蛋白的可能性也很小。
3）在不同组织、细胞、细胞器中，蛋白的表达丰度差异很大，传统的CO-IP等实验很难发现低丰度蛋白，人类蛋白组芯片上的蛋白是酵母纯化表达的蛋白，可以保证每种蛋白的丰度，芯片实验容易发现潜在的结合蛋白。
4）利用20k人类蛋白组芯片实验筛选互作蛋白，从蛋白质层面分析互作数据，避免了CO-IP后质谱鉴定时，从多肽水平跨层分析互作蛋白的不确定性和复杂性。
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上一个:
SPR分子互作技术经典仪器参数对比
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药物蛋白靶点主要有哪四大家族？
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