会议信息

华盈生物成功协办2016中美蛋白组学信息技术高级研讨会

2016/09/20

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       由上海市生物信息学会、上海交通大学系统生物医学研究院等单位主办的中美蛋白质组学信息技术高级研讨会于2016年9月10日-14日在上海交通大学医学院召开。本次会议邀请美国西雅图系统生物学研究所Trans-Proteomics Pipeline(TPP)软件研发团队核心成员来华亲自授课,课程围绕如何利用其开源软件对大规模定量蛋白质组学实验、靶向定量方法、蛋白相互作用实验等串联质谱数据进行存储、分析、验证和功能注释等蛋白组学研究中最关键的问题逐一展开。

      
上海华盈生物医药科技有限公司作为此次蛋白组学高级技术研讨会的主要协办方,我们积极努力地为这次蛋白组学信息技术巅峰盛宴提供了各种会务保障。

2.jpg研讨会情况


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       培训全程采用英文授课形式,参会人员全神贯注地学习TPP软件的每一个应用程序。在自由提问时间,参会人员踊跃发言,与授课老师交流心得,讨论气氛十分热烈。华盈生物技术支持骨干也参与了本次研讨会,认真学习了这款蛋白组学数据高级分析软件,并顺利完成所有课程获得培训认证,我们将在近期引进这款强大的质谱数据分析软件。

2.jpg研讨会简介

   
  2001年,Science 杂志把蛋白质组学列为六大研究热点之一,预示着蛋白质组学研究已成为21世纪生命科学的重要战略前沿。随着蛋白质组学的兴起,质谱技术随之迅猛发展,质谱技术产生的数据量非常庞大,其数据处理与分析方法一直在不断更新和演化中。高效先进的计算机算法、实用的软件工具与硬件是处理大批量的质谱数据中关于蛋白质鉴定、翻译后修饰分析、蛋白质定量、蛋白质定位等问题的核心环节。

      
本次研讨会邀请到西雅图系统生物学研究所(ISB)蛋白质组学中心主任,世界蛋白组学学会(HUPO)组织现任副主席——Robert Moritz教授,及其Trans-Proteomics Pipeline (TPP)软件开发团队,就目前蛋白组学领域的最前沿技术和科学进展与国内学者进行面对面深入交流。Robert Moritz教授团队于2016年7月28日在顶级期刊Cell上发表了题为 “Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome” 的研究论文。该项研究被业界认为是人类蛋白组研究里程碑式的进展。Robert Moritz教授携最新的SRMAtlas研究成果和与会的国内学者亲切互动交流。SRMAtlas是基于SRM技术生成的“金标准参照质谱谱系”,能以高灵敏度和高选择性来确定和量化任何组生物样本中任何人类蛋白质。
     
      
同时,此次会议还专门开辟了蛋白组学数据开源集成分析软件TPP培训课程,由美国西雅图系统生物学研究所的TPP团队现场授课,以解决蛋白组学数据标准化分析和数据挖掘问题。课程系统性讲解了TPP软件PeptideProphet,iProphet,ProteinProphet,ASAPRatio等组件的应用。TPP是一款开源软件,包含一系列蛋白质鉴定和定量分析的模块,是用于LC/MS/MS蛋白质组学数据分析软件的集合。TPP软件能够对经Sequest、Mascot和SpectraST等数据库搜索引擎得到的结果进行筛选过滤,从而达到蛋白质鉴定和测序的目的,实现对串联质谱数据的存储、分析、验证和功能注释等。

2.jpg特邀主讲人

                                          

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        Robert Moritz教授

       现任系统生物学研究所(ISB)蛋白质组学中心主任,世界蛋白组学学会(HUPO)组织现任副主席。

       在Richard J. Simpson蛋白质结构实验室从事科研工作期间,Moritz教授设计并发展了被业界广泛采用的蛋白质组学微色谱分析、微分离等技术。同时,在细胞因子、蛋白质受体及其三维结构、蛋白相互作用等研究领域也取得了重大进展,相关文章发表在Nature等等国际顶级学术期刊上。

       2005至2006年底,Moritz教授建立澳大利亚蛋白质组学计算中心并担任主任,目前该中心已可以供全世界蛋白质组学研究人员进行数据分析。2008年至今,Moritz教授一直致力于将ISB蛋白质组学中心发展为全球型的蛋白质组学数据在线分析平台。


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中方特邀嘉宾


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                  严威教授

       上海交通大学系统生物医学研究院教授、研究员,是著名定量蛋白质组学专家、第二批上海“千人计划”入选者。研究方向:蛋白质组学、质谱技术、疾病相关生物标识物的研发。

       2002-2013年在系统生物学研究所(Institute for Systems Biology)从事蛋白质组学和系统生物学研究,先后担任研究科学家(Research Scientist)和资深科学家(Senior Research Scientist)。2011年任中国科学院上海高等研究院兼职研究员;2013年加入上海交通大学系统生物医学研究院,入选上海“千人计划”。


2.jpg研讨会主题

                                 

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2.jpg研讨会课程安排
        

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2.jpg展望

       
       此次研讨会充分说明华盈生物走在了蛋白组学研究领域的前沿,具有敏锐的科研嗅觉,强大的科研服务能力。衷心希望各位老师持续关注华盈生物,我们会继续聚焦最新科研动态,为科研工作者提供广阔的学术交流平台,共同推动蛋白组学向更高效更系统的方向发展。