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    label free非标记定量蛋白质组学

    Label Free定量


            蛋白质非标记定量技术(Label Free),是直接通过液相色谱质谱(LC-MS)技术结合复杂的数据分析方法对蛋白质酶解肽段进行半定量检测的技术。目前Label Free主要的数据分析方法是利用Maxquant软件,根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相色谱保留时间等信息进行定量分析的方法(如右图);

          相比较iTRAQ/TMT等标记方法,Label Free具有特定的技术优势:a. 检测起始样本量少; b. 前处理少,更多保留样本最原始信息;c. 对于低丰度多肽的覆盖程度更高;d. 不受标记试剂盒限制,可进行大批量的样本检测。

     

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    技术路线


                       

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    主要仪器设备

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    样品要求

                

     

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    应用方向

                       
                        ◇   发病机理研究
                        ◇   药物靶点研究
                        ◇   疾病标志物筛选
                        ◇   植物品种改良
                        ◇   工程菌改造
                        ◇   特殊功能蛋白质筛选

    客户代表文章


    1. Chen XJ, et al. Homoharringtonine deregulates transcriptional expression by directly binding NF-κB repressing factor. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Feb 5;116(6):2220-2225.(IF=9.504,上海交大医学院附属瑞金医院)

    2. Li R, et al. Expressway to Rheumatoid Arthritis by Macrophage-derived Microvesicle-Coated Nanoparticles. Nano Lett., 2018. (IF=12.08,复旦大学)

    3. Huang H, et al. Kisspeptin/GPR54 signaling restricts antiviral innate immune response through regulating calcineurin phosphatase activity. Science Advances, 2018, 4(8): eaas9784. (IF=11.5,华东师范大学)

    4. Yang L,  et al. Lectin Microarray Combined with Mass Spectrometry Identifies Haptoglobin-Related Protein (HPR) as a Potential Serologic Biomarker for Separating Nonbacterial Pneumonia from Bacterial Pneumonia in Childhood. Proteomics Clin Appl, 2018, 12: e1800030.(IF=3.567,上海儿童医学中心)

    5. Jiang P, et al. Quantitative proteomics analysis of differentially expressed proteins in ruptured and unruptured cerebral aneurysms by iTRAQ. Journal of Proteomics, 2018, 182. (IF=3.722,首都医科大学附属北京天坛医院)

    6. Sun H M, et al. PALLD Regulates Phagocytosis by Enabling Timely Actin Polymerization and Depolymerization. J Immunol. 2017 Sep 1; 199(5): 1817-1826.  (IF=4.539,上海交大医学院附属瑞金医院)

    7. You D, et al. Acetyl coenzyme A synthetase is acetylated on multiple lysine residues by a protein acetyltransferase with a single Gcn5-type N-acetyltransferase (GNAT) domain in Saccharopolyspora erythraea. J Bacteriol. 2014 Sep; 196(17): 3169-78. (IF=3.219,华东理工大学)