蛋白质组学详细

非标记定量蛋白质组学 > 非标记定量蛋白质组学

    非标记定量蛋白质组学

    Label Free定量


            蛋白质非标记定量技术(Label Free),是直接通过液相色谱质谱(LC-MS)技术结合复杂的数据分析方法对蛋白质酶解肽段进行半定量检测的技术。目前Label Free主要的数据分析方法是利用Maxquant软件,根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相色谱保留时间等信息进行定量分析的方法(如右图);

          相比较iTRAQ/TMT等标记方法,Label Free具有特定的技术优势:a. 检测起始样本量少; b. 前处理少,更多保留样本最原始信息;c. 对于低丰度多肽的覆盖程度更高;d. 不受标记试剂盒限制,可进行大批量的样本检测。

     

    B1.jpg

    技术路线


                       

    B2.jpg               

                   
                   

    主要仪器设备

     

    Q Exactive Plus 组合型四极杆 Orbitrap 质谱仪

    分辨率:140000 at m/z 200,可选 280000 at m/z 200
    扫描速率:最高12 HZ
    质量数范围:m/z 50- 6000 
    应用范围:高通量蛋白质鉴定——复杂样品
                     定量蛋白质组学——iTRAQ/TMT定量
                     修饰蛋白组分析                 


    Q-Exactive-Plus-with-UltiMate-RSLC-Front.jpg-650.jpg


    样品要求

                

     

    TT.jpg

     

    应用方向

                       
                        ◇   发病机理研究
                        ◇   药物靶点研究
                        ◇   疾病标志物筛选
                        ◇   植物品种改良
                        ◇   工程菌改造
                        ◇   特殊功能蛋白质筛选

    相关文献

    1.  Vanderschuren H, et al. Large-scale proteomics of the cassava storage root and identification of a target gene to reduce postharvest deterioration. Plant Cell, 2014, 26(5): 1913-1924.

    2. Cholewa B D, et al. Large-scale label-free comparative proteomics analysis of polo-like kinase 1 inhibition via the small-molecule inhibitor BI 6727 (Volasertib) in BRAFV600E mutant melanoma cells. J Proteome Res, 2014, 13(11): 5041-5050.